quanzhangzhuanluzucexu(iso-seq)shijiyupacbiodanfenzishishicexujishu,pingjiechaozhangduzhangdeyoushi(pingjunduzhang10-15kb),keyiqingsongkuayuecong5'moduandao3'-poly aweidewanzhengzhuanluben,wuxudaduanrnafenzi,congerhuodegaozhiliangquanzhangzhuanlubenxulie。
tongguoquanzhangzhuanluzucexunenggougengjingzhundidedaomrnaquanzhangxuliejiwanzhengjiegouxinxi,keyiduixinjiyinjiqiiso-formjinxinggengquanmiandeyanjiu,kefulezhuanlubenerdaicexupinjieduan、xinxibuwanzhengdenanti;shixianduikebianjianjie、tongyuanyigouti、tongyuanjiyin、dengweijiyin、ronghejiyindengjingquefenxi。zhuyaoyingyonglingyuyoubijiaozhuanluzuxue、fayuzhuanluzuxue、huanjingzhuanluzuxue、fuzhujiyinzuzhushi、zhongliujibingyanjiudeng。
我们的优势
chaozhangduzhang,quanmianfugaiwuxupinjie,huoqumrnaquanzhangxulie
高质量的数据保障
jingzhunjiandinggengduoxinjiyinhexinzhuanluben
丰富的项目经验
全面的分析内容
zhouqiduan,youjingzhenglidejiageyoushi
可定制的项目设计
技术流程
数据分析
全长无参转录组分析
标准分析:
1. 原始数据处理
2. 全长转录本分析:插入片段质控、转录本分类、聚类与矫正
3. 转录本注释:Gene Ontology分析、KEGG pathway分析、KOG或COG分析、Swissport分析
4. jiyinjiegoufenxi:kebianjianqiefenxi、ssrfenxi、cdsfenxi、lncrnafenxi、jiyinjiazufenxi
高级分析:
1. 参考序列比对
2. 表达水平分析
3. 差异表达分析
4. 差异表达转录本KEGG富集分析
5. 差异表达热图分析
6. chayibiaodazhuanlubengofujifenxi
全长有参转录组分析
标准分析:
1. 原始数据处理
2. 全长转录本分析:插入片段质控、转录本分类、聚类与矫正、与参考基因组比对
3. 转录本注释:Gene Ontology分析、KEGG pathway分析、KOG或COG分析、Swissport分析
4. jiyinjiegoufenxi:zhuanlubenjiegouzhushi、kebianjianqiefenxi、ssrfenxi、xinzhuanlubenyuce、cdsfenxi、lncrnafenxi、ronghejiyinjianding
高级分析:
1. 参考序列比对
2. 表达水平分析
3. 差异表达分析
4. 差异表达转录本KEGG富集分析
5. 差异表达热图分析
6. 差异表达转录本GO富集分析
7. 基因表达趋势分析
8. 权重共表达网络分析
9. yangbenjianchayironghejiyinbijiao
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | RIN值 |
Total RNA | ≥5 mg | ≥300 ng/μl | ≥ 8 |
技术参数
测序平台 | 文库类型 | 数据量 | 运转周期 |
PacBio SMRT | ~10 Kb | 10 G/样本 | 视具体项目情况而定 |